第一阶段：自我认识阶段
即通过心理咨询师引导，来访者与心理咨询师一起通过呈现、回顾、讨论、分析、检验，发现自我心理模式及心理模式如何形成的阶段。这个阶段要经历两个过程：
（1）诊断过程
在咨询师的引导下，对来访者描述的症状、生活情况、成长史等资料，进行整体呈现、回顾，然后通过共同讨论、分析，理清心理活动模式的轮廓，澄清需要模式、思维模式与行为模式。
（2）诊断确认过程
在咨询师的指导下，来访者带着家庭作业，回到生活中去体会生活中的心理活动与行为。并将其模式特征与成长经历体验相对照，在情景中体会咨询中对自我心理活动模式的诊断，确认诊断的正确性。
第二阶段：旧模式认知阶段
即通过咨询中对事件过程的呈现、讨论、分析，引导来访者认识自我在日常事件的心理活动中的动机指向与注意、思维、行为的基本特征，然后将咨询中呈现、讨论、分析的方法，作为家庭作业，带回到现实生活中，通过事后分析，发现自我心理模式的规律。这一阶段也要经历两个过程：
（1）事后分析方法熟悉过程
这一过程一般很难做到将动机指向与注意、思维、行为的基本特征分析清楚，只能进行大致的分析，主要是熟悉分析方法。
（2）事后清晰发现与即时模糊觉察
通过一段时间的事后分析熟悉分析方法后，来访者能够在事后分析中，清晰地发现自我在日常生活事件中心理活动的基本特征，并且从整体上明确地认识到这种模式特征是如何在成长过程中形成的，最后在现实生活的即时状态下，也能当场发现自己心理活动所处的模式状态，并作出部分的即时控制与调整。
第三阶段：旧模式觉察阶段
即通过咨询中对事件点上来访者的心流细节的呈现，深入到心流细节过程中，引导来访者发现自我心理活动的注意细节、思维的细节过程、行为的深层动机与需要、行为的效应、情绪情感流动与认知及行为效应（需要满足状态）之间的关系，从而发现自我的心理模式是如何具体地让自我陷入痛苦情绪和无效或低效率甚至反效行为之中的，对自我的心理模式产生清晰、具体的体验。然后带着咨询室中体会到的方法，回到现实中进行觉察。
这一阶段也将经历两个过程：
（1）事后觉察过程
带着咨询室中体会到的方法回到生活中做作业，在事件发生后对自我的心流过程进行正向或反向回顾，仔细体会事件当时的心理流动过程，从中体会自我心理活动的注意细节、思维的细节过程、行为的深层动机与需要、行为的效应、情绪情感流动与认知及行为效应（需要满足状态）之间的关系，从而发现自我的心理模式是如何具体地让自我陷入痛苦情绪和无效或低效率甚至反效的行为之中的。
（2）即时觉察过程
经过一段时间的事后心流觉察后，来访者会自然地做到在事件发生的即时状态下觉察到自我的心流过程，但最初是较为模糊、不清晰、不确定的，随着即时觉察增多，慢慢地便会能够在即时状态下，通过自主调节，终止旧模式的心流过程，对环境做出部分的适应性的认知与行为反应。
第四阶段：旧模式调整阶段
即通过咨询室中的呈现、比较，引导来访者发现旧模式中的行为效应、相同情景下的不同认知与行为方式（新模式）及其效应，并将两种模式与效应进行比较，让来访者体会到在相同事情情景下，可以采用与旧模式完全不一样的认知与行为方式，获得自己更想要的结果。然后带着咨询室中学会的方法回到生活中去反复体验。
这一过程也将经历两个过程：
（1）事后觉察过程
即通过事后觉察的作业，逐步熟悉觉察方法、发现新模式的方法、体会新旧模式的不同效应。
（2）即时调整过程
通过一段时间的事后觉察后，来访者会自然地做到在即时状态下能够进行自我觉察，并及时尝试应用新模式对事件进行认知与应对。
第五阶段：自我认同阶段
即通过咨询室中在事件点上的心流过程呈现，引导来访者发现导致旧模式、难以使用新模式的核心原因是在需要“饥渴”状态下，自我恐惧需要再次不能得到满足，而被环境的“需要威胁信息”所控制，看不见自我能力、不信任自我，使得自我力量得不到释放，只要在即时状态下能看见并信任自我的力量，就能摆脱“需要威胁信息”的控制，让自我的潜能释放出来。然后带着作业回到生活中，运用咨询室中体会到的方法，不断发现自我的亮点与力量，并体会到其存在，逐步形成清晰、确切、稳定的自我认同感，释放信心。
这一过程也将经历事后觉察与即时应用两个阶段。这一阶段有个典型特征：自信心显著地提升。
第六阶段：新模式重建阶段
第五阶段发生后，新模式即开始成长，逐步替代旧模式。这一阶段在咨询室中，咨询师主要做的是呈现来访者在具体事件中的新认知与行为应对的亮点，引导来访者关注到自我亮点与力量，发现自我在不断的成长，体会新模式带来的现实效应与心理感受，领悟自我感受与现实处境，完全是由自我的认知与行为模式决定的，自我完全有能力让自己的需要得到良好的满足，创造美好的生活，不需要抱怨与依赖任何人。
这一阶段同样要经历事后觉察与即时体会两个阶段。
第七阶段：新模式稳定阶段
第六阶段来访者尚处于不稳定阶段，一旦遇到较大压力时，心理状态会出现明显的波动，旧模式尚比较容易跳出来，自信心不稳定，情绪稳定性也不够。这一阶段需要在咨询室中，通过多重事件串联，呈现来访者的总状态，引导来访者清晰地看到自我所处的新模式状态，正确地认识、面对旧模式的出现，还需通过具体的事件呈现，让来访者不断感受自我的力量与新模式的具体状态，然后带着作业回到生活中进行自我发现与体验验证。
第八阶段：自我力量增长阶段
经过第七阶段的新模式稳定后，来访者的自我力量感会迅速上升，但这时的自信感还不够充分，会担心离开咨询师的支持，自己是否能够继续保持状态的稳定。因此，这一阶段要逐步减少咨询的频率，在咨询室中关注的重点是通过整体状态与具体事件的呈现，让来访者逐步感受到自我已经拥有了独立的自我成长能力。
第九阶段：自我圆熟阶段
经过第八阶段后，来访者已经基本信任自我具有独立的自我成长能力，但是还会因为遇到很多事情自己不能很开放地的对其进行认知、灵活地应对，所以对咨询师的依赖感并未完全消除。这时候，咨询基本上可以终止。咨询师需鼓励来访者大胆地去自我尝试，告诉来访者经过自我尝试一定会发现自己逐步会变得圆熟起来，当来访者经过独立尝试一些重要的事或一段时间后，来访者会真切地体会到自己真的能完全独立的步上自我圆熟之路，这时，再回来进行一次分享，完成来访者与心理咨询师之间的心理上的分离之后，来访者就可以完完全全安心地走上自我圆熟之路了。
一个完整的、彻底的、永远不会再复发、实现真正的人格成长、来访者将来能完全依靠自我拥有美好生活、无论遇到什么压力都可以依靠自我力量很好地应对的心理治疗过程，必须完整地、透彻地经过以上九个阶段。任何一个阶段的心理过程经过不完整、不透彻，都会留下“后遗症”，必将大大影响来访者咨询结束后的生活质量，来访者以后必将很容易陷入再次的心理困扰之中，尤其是在遇到较大的压力的时候。
完成这九个过程的时间长短，取决于来访者来时的基础状态、领悟与执行力、生活因素的干扰、咨询师的专业水平、咨询过程中的设置是否很好地遵循了阶段性成长的规律等多重因素，其中最关键的是来访者的领悟与执行力、咨询师的专业水平。
咨询过程中，来访者执行作业、在事件中进行深入的自我心流体验是关键，只有认知，没有深入的现实生活中的自我心流体验的心理治疗，永远不可能让来访者真正实现自我成长——心理模式的根本性改变。
九阶段模式的心理治疗，调动的是来访者自身本来就拥有但未释放的能力，而非任何外力的支持，所以，无需所谓“创伤修复”，其所谓的“童年创伤”是可以完全不需要“原生对象”或“移情对象”的心理需要满足的支持的。“原生对象”与“移情对象”的需要满足支持，在前五个阶段中能起到良好的积极作用，但如果“原生对象”不能提供良好的支持与配合、“移情”处理不好，反而是很危险的。
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